본 연구실에서는 미생물에 의한 환경오염물질 분해와 분자생물학적 방법에 의한 미생물 생태 분석에 관련된 연구를 수행하고 있다. 미생물 분해에 관련해서는 관여된 미생물을 순수 분리하고, 분해활성, 분해유전자등을 연구하며, 분해미생물의 계통분류학적 특성, 환경적응능력, 실제 환경에서의 군집 역학 등을 연구한다. 미생물 생태 분석에서는 GMO (Genetically-Modified Organism)의 환경 방출에 따른 토착미생물상의 변동, 유전물질의 이동과 확산, 도입된 유전자 변형미생물의 생존과 활성 등에 관하여 연구를 수행하고 있다. 현재 본 연구실에서는 다음과 같은 분야의 연구를 진행하고 있다.

♦ 환경오염물질 분해미생물 연구
경작토양에 광범위하게 사용되고 있는 제초제와 살충제의 분해에 관여된 토양미생물에 대하여 연구하고 있다. carbofuran, benomyl, butachlor, alachlor 등의 농약 성분을 분해하는 미생물을 전국 각 지역의 경작토양에서 분리하여, 분해미생물의 종다양성, 생리학적 특성을 밝히고, 각 농약성분의 분해경로와 분해유전자를 규명하는 연구를 하고 있다. 특히 분해능과 분해다양성이 뛰어난 미생물을 선별, 개발하여 오염된 경작토양 및 산업폐수에 처리하였을 때 이들 미생물이 어느 정도 대사활성을 나타내고, 특정미생물과 전체미생물 군집에 어떠한 변화가 생기는가를 분자생태학적인 방법을 사용하여 연구하고 있다.

♦ plasmid 유전체 연구
환경오염물질을 분해하는 미생물이 가지고 있는 분해유전자가 들어 있는 plasmid를 연구하고 있다. 유용한 분해유전자를 가지고 있는 plasmid의 전체 염기서열을 분석하여 각 plasmid의 유전적, 구조적 특성을 비교 분석하고 새로운 분해유전자를 탐색 분리하여 발현조건을 연구하며, 분해효소의 활성과 특성에 대하여 연구하고 있다.

♦ 유류분해 미생물 연구
토양에 오염된 유류를 분해하는 미생물에 대해 연구하고 있다. 유류오염에 따른 토착미생물상의 변동, 유류 분해미생물, 생물학적 환경적 요인의 영향 등을 분석하고 있고, 분리된 유류 분해미생물을 이용하여 유류 오염지역을 생물학적으로 복원하는 연구를 수행하고 있다.

♦ 분자미생물 생태 연구
형질전환식물체 (LMO)의 재배에 따른 토양미생물상의 변화에 대해 연구하고 있다. 토양미생물 군집 구조의 변화, 식물체에 도입된 유전자의 토양 잔류, 이동과 전파 등 형질전환 식물체가 근권미생물에 미치는 영향 등을 DGGE, Competitive PCR, Hybridization, Soil FAME, Pyrosequencing 등의 분자생물학적 방법에 의해 연구하고 있다.